L’Archivio dell’Istituto Mazziniano conserva  raccolte documentarie, iconografiche e fotografiche,  relative a fatti e personaggi  dal XVIII al XX secolo, con particolare riferimento alla storia del Risorgimento. La documentazione risorgimentale  comprende testimonianze  relative ai principali protagonisti delle vicende risorgimentali (Giuseppe Mazzini, Giuseppe Garibaldi, i fratelli Ruffini, Goffredo Mameli, Raffaele Rubattino)  e della movimento operaio mutualistico mazziniano. La raccolta si è formata nel corso del tempo attraverso acquisti e donazioni.    
Nel 2011, in occasione del 150° anniversario dell’Unità d’Italia, la Soprintendenza archivistica per la Liguria e il Ministero dei Beni ed Attività Culturali hanno promosso e  sostenuto finanziariamente il progetto di ricognizione, riordinamento  e inventariazione informatizzata della documentazione.  Da allora le raccolte hanno continuato ad incrementarsi grazie a donazioni.