L’Archivio di Stato di Messina conserva circa 6,5 km lineari di documentazione, che costituisce una fonte di primaria importanza per la storia della città e della provincia messinese dal XIII secolo fino ai giorni nostri. Il patrimonio archivistico custodito comprende le carte prodotte dalle istituzioni politiche, amministrative e giudiziarie preunitarie e da quelle statali post-unitarie comprese nel territorio della provincia, nonché archivi di enti pubblici, di famiglie, di persone, di associazioni e di altri organismi privati che rivestono o hanno rivestito un interesse storico particolarmente importante.
Tra i fondi maggiormente consultati si segnalano: Corporazioni religiose soppresse, Genio civile, Prefettura, Stato civile, Ufficio di leva e Atti notarili. Di particolare interesse storico sono, inoltre, il Fondo pergamenaceo e l’archivio della Curia stratigoziale, magistratura unica in tutta Italia.